Σεμινάριο με τίτλο: “Βιοπληροφορική” από την Bioprobe

Σας προσκαλούμε στο σεμινάριο “Βιοπληροφορική” που θα διεξαχθεί στις εγκαταστάσεις των εργαστηρίων μας στις 19 και 20 Φεβρουαρίου 2011.
Κάθε χρόνο η BioProbe διοργανώνει μια σειρά από πρακτικά και θεωρητικά σεμινάρια σε τεχνικές αιχμής της μοριακής βιολογίας και σχετικών επιστημών.

Τα σεμινάρια της Bioprobe σάς δίνουν την ευκαιρία να εμβαθύνετε σε βιολογικά θέματα και τεχνικές, υπό την καθοδήγηση εξειδικευμένων επιστημόνων, με εξοπλισμό υψηλής τεχνολογίας, σε ένα επαγγελματικό, φιλικό και άνετο περιβάλλον.

Περιεχόμενο & σκοπός:
Η ανάλυση της βιολογικής πληροφορίας με τη βοήθεια ηλεκτρονικού υπολογιστή (in silico) αποτελεί σήμερα αναπόσπαστο τμήμα μιας
ολοκληρωμένης μελέτης μοριακής βιολογίας.  Στο σεμινάριο γίνεται αναλυτική παρουσίαση και συζήτηση θεμάτων βιοπληροφορικής (υπολογιστικής
βιολογίας) και των προβλημάτων που μπορούν να προκύψουν, καθώς και εντατική πρακτική άσκηση σε in silico αναλύσεις πάνω σε διαφορετικά είδη
βιολογικής πληροφορίας. Στο τέλος του σεμιναρίου, οι συμμετέχοντες θα έχουν αποκτήσει τις απαραίτητες γνώσεις για να εφαρμόζουν βασικές
αναλύσεις πάνω σε ήδη γνωστές αλληλουχίες, ή αλληλουχίες που θα ανακτήσουν κατά την εφαρμογή διαφορετικών πειραμάτων, καθώς και να
αναλύουν τα αποτελέσματα.

Σε ποιούς απευθύνεται:
Το σεμινάριο απευθύνεται σε προπτυχιακούς και μεταπτυχιακούς φοιτητές, τεχνικό και επιστημονικό προσωπικό, που ενδιαφέρονται να ασχοληθούν με
αναλύσεις βιολογικής πληροφορίας in silico, τόσο σε συνδυασμό με πειραματικές διαδικασίες όσο και για προετοιμασία επιστημονικών
εργασιών. Δεν απαιτείται καμία προηγούμενη γνώση βιοπληροφορικής.

Διδάσκοντες:
Προσκεκλημένοι καθηγητές και ερευνητές με πλούσια εμπειρία στην τεχνική, καθώς και το διδακτικό και τεχνικό προσωπικό της BioProbe, θα
συμμετέχουν στην παρουσίαση των θεωρητικών μαθημάτων αλλά και του πρακτικού μέρους του σεμιναρίου.

Περιεχόμενο σεμιναρίου:
Θεωρητικό μέρος
• Βιολογικές βάσεις δεδομένων
• Τρόποι αναζήτησης σε μια Βάση Δεδομένων – Ανάκτηση δεδομένων
• Αναζήτηση ομολογιών (BLAST)
• Gene prediction methods
• Αναλύσεις νουκλεοτιδικών-αμινοξικών αλληλουχιών
• Ανάλυση ενζύμων περιορισμού
• Βασικές αρχές σχεδιασμού των εκκινητών
• Ευθυγράμμιση αλληλουχιών
• Αρχές φυλογενετικής ανάλυσης

Πρακτικό μέρος:
• Εξοικείωση με ιστοσελίδες ανάλυσης in silico της βιολογικής
πληροφορίας
• Ανάκτηση αλληλουχιών από βάσεις δεδομένων
• Χειρισμός – Αποθήκευση αλληλουχιών
• Αναζήτηση ομόλογων αλληλουχιών
• Ταυτοποίηση – Χαρακτηρισμός αλληλουχιών
• Δημιουργία περιοριστικού χάρτη
• Σχεδιασμός εκκινητών για PCR-sequencing
• Κατασκευή φυλογενετικού δέντρου
• Ανάλυση – επεξεργασία αποτελεσμάτων

Πρόγραμμα του σεμιναρίου:
ΣΑ 19/2/11 – 09:30 – 16:30
ΚΥ 20/2/11 – 11:00 – 16:30

Αριθμός συμμετεχόντων:
Ο αριθμός των συμμετεχόντων δεν μπορεί να είναι υπερβαίνει τον αριθμό των 20 ατόμων, ώστε να εξασφαλιστεί το καλύτερο δυνατόν περιβάλλον μάθησης και διαδραστικής αλληλεπίδρασης.

Μετάβαση στο περιεχόμενο